Der gleiche Effekt ist übrigens bei den "Mail-Service"-Einstellungen zu beobachten! Es scheint ein grundsätzlicher Effekt des Checkbox-Controls zu sein.

Hm, das ist leider ein spezifisches Linux-Problem. Das muß separat geklärt werden, wohl erst in der nächsten Version.

EDIT: Hab's gerade mal unter Kubuntu ausprobiert, da paßt es ganz gut. Liegt also wohl eher am Fenstermanager. Welchen verwendest Du da und welches Theme?

Ich habe keine besondere Entscheidung getroffen. Laut der Anleitung auf https://wiki.ubuntuusers.de/Fenstermanager/ verwende ich "Mutter".

Wie es scheint liegt es nicht an der Checkbox an sich, da wie im Screenshot zu sehen die untere Checkbox klar als aktiv erkenntlich ist. Tritt also wohl nur auf wenn die Checkbox als Teil der Beschriftung einer Feldgruppe verwendet wird.
Screenshot aus Fedora Workstation mit Gnome 50.

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wird vermutlich mit einer aktuelleren Nebula-Version behoben. Der Fehler kann nicht direkt in Fakturama behoben werden, weil das eine externe Library ist.